Tek Hücre ve Uzamsal Boyutta Canlılık
Etkinlik Bilgileri
- Mekân Bilimler Köyü
- Son Kayıt Tarihi 11 Ağustos 2025
- Geliş Tarihi 10 Ağustos 2025
- Başlangıç Tarihi 11 Ağustos 2025
- Bitiş Tarihi 17 Ağustos 2025
- Kontenjan 15 kişi
- Kimlere? Herkes
- Etkinlik Ücreti 9.000 TL
Etkinlik Amacı
Bu atölye, biyolojide tek hücre ve uzamsal ölçeklerdeki yaşamın derinlemesine anlaşılmasını sağlamak için tasarlanmıştır. Katılımcılar, merkezi dogma, veri işleme, entegrasyon, hücre tipi isimlendirilmesi, gen düzenleyici ağlar ve hücreler arası iletişim gibi temel konuları keşfedecekler. Ayrıca, uzamsal transkriptomik ve uzamsal veri analizi gibi ileri düzey yöntemlere giriş yapılacak. Çalıştay, teorik bilgilerin yanı sıra pratik uygulamalara da odaklanarak, Conda ortamı kurulumu ve AnnData formatıyla çalışma gibi teknik becerilerin geliştirilmesine imkan tanıyacaktır. Kurs projeleri aracılığıyla, ekip çalışması ve hipotez geliştirme becerileri desteklenecek ve gerçek biyolojik problemlere çözümler üretilecektir.
Ek Bilgi
Temel biyoloji bilgisi, istatistiki kavramlara aşinalık, İngilizce, taşınabilir bilgisayar
Etkinlik Takvimi
| Gün | İçerik |
|---|---|
| 1. Gün |
Sabah Farklı ölçeklerde hayat Biyolojide bilgi akışı: santral dogma
Öğleden Sonra Conda ortamının kurulumu ve Python araçları Visual Studio Code ve Jupiter not defterleri AnnData formatına giriş |
| 2. Gün |
Sabah Örnek olay çalışması: Meme kanserinde Epitel-Mezenkimal geçiş Kurs projesi: Takımların oluşturulması ve hipotezlerin belirlenmesi
Öğleden Sonra Veri ön işleme Entegrasyon ve parti (batch) düzeltme Hücre tipi isimlendirmesi |
| 3. Gün |
Sabah İçsel ve dışsal bilgilerin çıkarımı Kopya numarası değişiklikleri Gen düzenleyici ağlar Hücreler arası iletişim
Öğleden Sonra Kopya numarası değişikliklerinin çıkarımı Transkripsiyon faktörleri Ligand-reseptör çiftleri |
| 4. Gün |
TATİL |
| 5. Gün |
Sabah İki boyutta hayat Uzamsal transkriptomik
Öğleden Sonra Uzamsal veri işleme Spot isimlendirilmesi Komşulukların bulunması: SpottedPy Uzamsal hücreler arası iletişim |
| 6. Gün |
Kurs projesi sunumları |
| 7. Gün |
Kapanış konuşması Katılımcılardan geri bildirim Köyden ayrılış |